В 2020 году Нэклис-банк потерял лицензию и был признан банкротом. В отношении банка были заведены два уголовных дела о мошенничестве. По одному из них Борискину и его заместителю Наталии Акуловой вменяется вывод активов из банка на сумму в 1,3 млрд рублей. Касперской принадлежали 64% банка. Когда у банка отозвали лицензию, она сразу заявила, что стала акционером по предложению менеджмента, не обдумав это решение. Она же предложила ЦБ в 2019 году обратить внимание на банк с целью «слить» его.. По другому делу, возбужденному в отношении неустановленных лиц, банкир проходит свидетелем. Оно касается обстоятельств получения банком субординированных займов, а также личного займа Борискину от кипрской компании Organat Financial Limited принадлежащей Касперской.
Борискин настаивает, что его задолженность погашена. Таким образом, требования Касперской в рамках дела могут быть расценены, как покушение на хищение денежных средств путем обмана.
14 января 2022 года Агентство по страхованию вкладов направило в Арбитражный суд г. Москвы заявление о привлечении контролировавших «Нэклис-Банк» лиц к гражданско-правовой ответственности в форме возмещения убытков в общем размере 1,5 млрд рублей. Заявление подано в отношении Акуловой Н.Ю., Алферова Д.С., Борискина С.С., Ларичева В.С., Петровой Е.Н., Уманского О.В. Ранее решением Арбитражного суда г. Москвы Банк признан несостоятельным (банкротом), в отношении него открыто конкурсное производство. Функции конкурсного управляющего возложены на Агентство. В ходе конкурсного производства Агентством установлено, что в Банке совершались действия по выдаче заведомо невозвратных ссуд. Кроме того, Банком необоснованно расторгались договоры залога транспортных средств, залогодержателем по которым выступал Банк. В результате указанных сделок Банку были причинены убытки.